Studia drugiego stopnia (magisterskie) poświęcone są przede wszystkim pogłębianiu zainteresowań studentów w ramach oferowanych przez Instytut Archeologii UW specjalności. Student pod kierunkiem wybranego promotora - opiekuna naukowego prowadzi w ramach seminarium magisterskiego samodzielne badania, których ukoronowaniem będzie praca magisterska. W ramach studiów magisterskich możliwa jest realizacja takich specjalizacji, jak archeologia paleolitu i mezolitu, archeologia neolitu i wczesnej epoki brązu, archeologia okresu protohistorycznego, archeologia średniowiecza i czasów nowożytnych, archeologia Grecji, archeologia Rzymu i prowincji rzymskich, archeologia Egiptu, archeologia Bliskiego Wschodu, archeologia Ameryk i Oceanii, jak również specjalizacji w naukach pomocniczych archeologii - antropologii ogólnej, bioarcheologii, recepcji antyku czy papirologii. W przypadku studiów niestacjonarnych zaocznych nie są dostępne wszystkie specjalności. Studentów obowiązuje zaliczenie ćwiczeń wykopaliskowych w wymiarze 3 miesięcy. Absolwent studiów II stopnia, uzyskując dyplom magistra archeologii, jest w pełni wykwalifikowanym archeologiem, upoważnionym do prowadzenia prac wykopaliskowych w kraju i poza jego granicami, opracowania i publikacji ich wyników oraz realizacji programów badawczych. Posiada również pełne kwalifikacje do pracy w placówkach muzealnych, jednostkach ochrony dziedzictwa kulturowego sektora państwowego i samorządowego, jak również służb celnych. Absolwent jest przygotowany do podjęcia studiów trzeciego stopnia (doktoranckich).
Czas trwania: 4 semestry